物理性殺菌是利用高溫、光線或摩擦力直接去除或殺滅微生物的過程。在保溫瓶清潔中，主要依賴高溫。 1. 沸水沖泡（內膽）： * 方式： 將 100∘C 的沸水倒入已刷洗乾淨的保溫瓶內膽，靜置 5−10 分鐘。* 效果： 高溫足以殺滅大部分細菌和黴菌孢子。這是一種安全且無化學殘留的內膽殺菌方式。注意： 僅限沖泡內膽，不可煮沸整個瓶身。2. 煮沸法（配件）： * 方式： 將矽膠墊圈、塑膠飲水口等可拆卸且耐熱的配件，放入沸水中煮 3−5 分鐘。* 效果： 這是最徹底的物理殺菌方式，尤其適用於黴菌最容易滋生的矽膠墊圈。3. UV-C 紫外線殺菌（新技術）： * 方式： 使用專門的 UV-C 殺菌瓶蓋或手持 UV 殺菌棒，照射瓶內壁 30 秒到 5 分鐘。* 效果： 紫外線能破壞微生物的 DNA 結構，達到廣譜殺菌效果，且完全無水、無化學殘留。許多新型智慧保溫瓶已內建此功能。4. 高溫烘乾（配件）： * 方式： 將已清潔的瓶蓋、墊圈等配件放入烘碗機中，以高溫模式烘乾。* 效果： 徹底去除水分的同時，烘碗機內的高溫也能對配件進行輔助殺菌，並且防止黴菌因潮濕而滋生。總結： 物理殺菌應以沸水沖泡內膽和煮沸配件為主。新型的 UV 殺菌技術則提供了一個無接觸、高效的殺菌選項。